Байкальский центр нейтринного телескопа находится на 106 км Кругобайкальской железной дороги (КБЖД). Эту железную дорогу начали строить еще в конце 19 века. До середины 20 века КБЖД была частью Транссибирской магистрали, пока не был введен в эксплуатацию дублирующий участок через Олхинское плато.